Pesquisadores Reconstroem Genoma De E. Coli Centenária Usando Fragmentos Extraídos De Múmia Italiana

Uma equipe internacional liderada por pesquisadores da Universidade McMaster, trabalhando em colaboração com a Universidade de Paris Cite, identificou e reconstruiu o primeiro genoma antigo de E. coli, usando fragmentos extraídos do cálculo biliar de uma múmia do século XVI.

Com informações de Archaeology News Network

Usando pedaços de um cálculo biliar de uma múmia de 1500, os pesquisadores conseguiram reconstruir o genoma da E. coli [Crédito: Divisão de Paleopatologia da Universidade de Pisa]

A E. coli é um grande problema de saúde pública, causando morte e morbidade significativas, mas não é uma fonte de pandemias. É conhecido como comensal, uma bactéria que reside dentro de nós e pode atuar como um patógeno oportunista infectando seu hospedeiro durante períodos de estresse, doença subjacente ou imunodeficiência.

Sua história evolutiva completa permanece um mistério, inclusive quando adquiriu novos genes e resistência a antibióticos, dizem os pesquisadores.

Ao contrário de pandemias bem documentadas, como a Peste Negra, que durou séculos e matou cerca de 200 milhões de pessoas em todo o mundo, não há registros históricos de mortes causadas por comensais como a E. coli, embora o impacto na saúde humana e na mortalidade tenha sido provavelmente tremendo.

“Um foco estrito em patógenos causadores de pandemias como a única narrativa de mortalidade em massa em nosso passado perde o grande fardo que decorre de comensais oportunistas impulsionados pelo estresse das vidas vividas”, diz o geneticista evolucionário Hendrik Poinar, diretor da McMaster’s Ancient DNA Center e pesquisador principal do Instituto Michael G. DeGroote para Pesquisa de Doenças Infecciosas da universidade.

A E. coli moderna é comumente encontrada nos intestinos de pessoas e animais saudáveis. Embora a maioria das formas seja inofensiva, algumas cepas são responsáveis ​​por graves, às vezes fatais, surtos de intoxicação alimentar e infecções da corrente sanguínea. A bactéria resistente e adaptável é reconhecida como especialmente resistente ao tratamento.

Ter o genoma de um ancestral de 400 anos da bactéria moderna fornece aos pesquisadores um ponto de comparação para estudar como ela evoluiu e se adaptou desde aquela época.

Os restos mumificados usados ​​para o novo estudo vêm de um grupo de nobres italianos cujos corpos bem preservados foram recuperados da Abadia de São Domingos Maggiore, em Nápoles, em 1983.

Para o estudo, os pesquisadores realizaram uma análise detalhada de um dos indivíduos, Giovani d’Avalos. Um nobre napolitano do período renascentista, ele tinha 48 anos quando morreu em 1586, e acredita-se que sofria de inflamação crônica da vesícula biliar devido a cálculos biliares.

“Quando estávamos examinando esses restos mortais, não havia evidências para dizer que este homem tinha E. coli. Ao contrário de uma infecção como a varíola, não há indicadores fisiológicos. Ninguém sabia o que era”, explica o principal autor do estudo, George Long. , estudante de pós-graduação em bioinformática da McMaster, que conduziu a análise com a coautora Jennifer Klunk, ex-aluna de pós-graduação do Departamento de Antropologia da universidade.

A façanha tecnológica é particularmente notável porque a E. coli é complexa e onipresente, vivendo não apenas no solo, mas também em nossos próprios microbiomas. Os pesquisadores tiveram que isolar meticulosamente fragmentos da bactéria alvo, que havia sido degradada pela contaminação ambiental de muitas fontes. Eles usaram o material recuperado para reconstruir o genoma.

“Foi tão emocionante poder digitar essa antiga E. coli e descobrir que, embora única, ela se enquadrava em uma linhagem filogenética característica de comensais humanos que hoje ainda causa cálculos biliares”, diz Erick Denamur, líder da equipe francesa que foi envolvidos na caracterização da cepa.

“Conseguimos identificar o que era um patógeno oportunista, investigar as funções do genoma e fornecer diretrizes para ajudar os pesquisadores que podem estar explorando outros patógenos ocultos”, diz Long.

A descoberta foi publicada na revista Communications Biology .

Fonte: Universidade McMaster [16 de junho de 2022]



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